Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms