Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms