Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms