Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cabp4Q8VHC5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms