Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r188Q8K3N2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r188Q8K3N2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms