Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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OptnQ8K3K8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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OptnQ8K3K8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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OptnQ8K3K8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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OptnQ8K3K8 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OptnQ8K3K8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms