Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms