Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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