Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcinQ8CDE2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcinQ8CDE2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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