Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp20Q8C6M1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp20Q8C6M1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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