Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rae1Q8C570 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rae1Q8C570 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms