Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atg16l1Q8C0J2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg16l1Q8C0J2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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