Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp54Q8BL06 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms