Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Htatsf1Q8BGC0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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