Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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