Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ChfrQ810L3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms