Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atg2bQ80XK6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Atg2bQ80XK6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms