Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GcsamQ6RFH4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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