Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms