Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pkp4Q68FH0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms