Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ccdc18Q640L5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc18Q640L5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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