Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms