Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm10639-202ENSMUST00000121273 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms