Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PtprnQ60673 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms