Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim58Q5NCC9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms