Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34b4Q3V0X2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms