Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC107711.6-201ENSMUST00000228455 1088 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ccl3-201ENSMUST00000001008 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms