Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp39Q3TIX9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp39Q3TIX9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Usp39Q3TIX9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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