Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Trappc13Q3TIR1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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