Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ttc39dQ0VF76 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc39dQ0VF76 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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