Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms