Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms