Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NfiaQ02780 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NfiaQ02780 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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