Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb4Q02738 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms