Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F8a1Q00558 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms