Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms