Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irx2P81066 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms