Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms