Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Acta1P68134 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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