Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp1P55194 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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