Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PctpP53808 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PctpP53808 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms