Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp9P49962 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1991.9 ms