Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TgfaP48030 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms