Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms