Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Rpl28P41105 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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