Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms