Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cd28P31041 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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