Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VtnP29788 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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