Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxrbP28704 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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