Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms